Santseharay Ramirez Almeida

Santseharay Ramirez Almeida

Lektor


  1. 2023
  2. Udgivet
  3. Udgivet

    Characterization of multi-DAA resistance using a novel hepatitis C virus genotype 3a infectious culture system

    Fernandez-Antunez, C., Wang, K., Fahnøe, Ulrik, Mikkelsen, L. S., Gottwein, Judith Margarete, Bukh, Jens & Ramirez Almeida, Santseharay, 2023, I: Hepatology. 78, 2, s. 621-636 16 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  4. Udgivet

    Durability and breadth of neutralisation following multiple antigen exposures to SARS-CoV-2 infection and/or COVID-19 vaccination

    Underwood, Alexander Paul James, Sølund, C., Fernandez-Antunez, C., Villadsen, S. L., Mikkelsen, L. S., Fahnøe, Ulrik, Bollerup, S., Winckelmann, Anni Assing, Schneider, Uffe Vest, Binderup, A., Vizgirda, G., Sørensen, A. L., Vinten, C. N., Dalegaard, M. I., Ramirez Almeida, Santseharay, Weis, Nina & Bukh, Jens, 2023, I: EBioMedicine. 89, 104475.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet

    First-in-human use of a modular capsid virus-like vaccine platform: An open-label, non-randomised, phase 1 clinical trial of the SARS-CoV-2 vaccine ABNCoV2

    Smit, M. J., Sander, A. F., Ariaans, M. B. P. A., Fougeroux, C., Heinzel, C., Fendel, R., Esen, M., Kremsner, P. G., Ter Heine, R., Wertheim, H. F., Idorn, M., Paludan, S. R., Underwood, A. P., Binderup, A., Ramirez, S., Bukh, J., Soegaard, M., Erdogan, S. M., Gustavsson, T., Clemmensen, S. & 14 flere, Theander, Thor Grundtvig, Salanti, Ali, Hamborg, M., de Jongh, W. A., McCall, M. B. B., Nielsen, Morten Agertoug, Mordmüller, B. G., COUGH-1 trial study group, C. T. S. G., Dagil, Robert, Goksøyr, L., Hulen, T. M., Brygger, C. M. J., Khalifé, P. K. & Vidal-Calvo, E. E., 2023, I: The Lancet Microbe. 4, 3, s. e140-e148

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  6. Udgivet

    Hepatitis C virus RNA is 5'-capped with flavin adenine dinucleotide

    Sherwood, A. V., Rivera-Rangel, L. R., Ryberg, L. A., Larsen, H. S., Anker, K. M., Costa, R., Vågbø, C. B., Jakljevič, E., Pham, L. V., Fernandez-Antunez, C., Indrisiunaite, G., Podolska-Charlery, A., Grothen, J. E. R., Langvad, N. W., Fossat, N., Offersgaard, A., Al-Chaer, A., Nielsen, L., Kuśnierczyk, A., Sølund, C. & 8 flere, Weis, Nina, Gottwein, Judith Margarete, Holmbeck, Kenn, Bottaro, S., Ramirez Almeida, Santseharay, Bukh, Jens, Scheel, Troels Kasper Høyer & Vinther, Jeppe, 2023, I: Nature. 619, s. 811-818

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  7. Udgivet

    Hepatitis C virus alters the morphology and function of peroxisomes

    Martin de Fourchambault, E., Callens, N., Saliou, J. M., Fourcot, M., Delos, O., Barois, N., Thorel, Q., Ramirez Almeida, Santseharay, Bukh, Jens, Cocquerel, L., Bertrand-Michel, J., Marot, G., Sebti, Y., Dubuisson, J. & Rouillé, Y., 2023, I: Frontiers in Microbiology. 14, 1254728.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  8. Udgivet

    Identification of the viral and cellular microRNA interactomes during SARS-CoV-2 infection

    Fossat, Nicolas Julien, Lundsgaard, Emma Alberte, Costa, Rui, Rivera, Lizandro, Nielsen, L., Mikkelsen, L. S., Ramirez Almeida, Santseharay, Bukh, Jens & Scheel, Troels Kasper Høyer, 2023, I: Cell Reports. 42, 4, 112282.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  9. Udgivet

    SARS-CoV-2 spike HexaPro formulated in aluminium hydroxide and administered in an accelerated vaccination schedule partially protects Syrian Hamsters against viral challenge despite low neutralizing antibody responses

    Christensen, D., Polacek, C., Sheward, D. J., Hanke, L., McInerney, G., Murrell, B., Hartmann, Katrine Top, Jensen, Henrik Elvang, Zimmermann, J., Jungersen, G., Illigen, K. E., Isling, L. K., Fernandez-Antunez, C., Ramirez Almeida, Santseharay, Bukh, Jens & Pedersen, Gabriel Kristian, 2023, I: Frontiers in Immunology. 14, 941281.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet
  11. 2022
  12. Udgivet

    Establishment of high-titer HCV and SARS-CoV-2 production in a scalable packed-bed bioreactor for inactivated vaccines inducing neutralizing antibodies in animals

    Offersgaard, A. F., Hernandez, C. R. D., Finne Pihl, A., Feng, S., Marichal-Gallardo, P., Venkatesan, N. P., Lin, X., Fernandez-Antunez, C., Pena Alzua, G., Costa, R., Hartmann, K. T., Pham, L., Zhou, Y., Gammeltoft, K. A., Fahnøe, U., Scheel, T. K. H., Schneider, U. V., Jensen, H. E., Christensen, J. P., Ramirez Almeida, S. & 4 flere, Reichl, U., Genzel, Y., Bukh, Jens & Gottwein, Judith Margarete, 6 jul. 2022.

    Publikation: KonferencebidragPosterFormidling

  13. Udgivet

    Establishment of high-titer HCV and SARS-CoV-2 production in a scalable packed-bed bioreactor for inactivated vaccines inducing neutralizing antibodies in animals

    Offersgaard, A. F., Hernandez, C. R. D., Finne Pihl, A., Feng, S., Marichal-Gallardo, P., Holmbeck, K., Venkatesan, N. P., Lin, X., Fernandez-Antunez, C., Pena Alzua, G., Costa, R., Hartmann, K. T., Pham, L., Zhou, Y., Gammeltoft, K. A., Fahnøe, U., Scheel, T. K. H., Schneider, U. V., Jensen, H. E., Christensen, J. P. & 5 flere, Ramirez Almeida, Santseharay, Reichl, U., Genzel, Y., Bukh, J. & Gottwein, Judith Margarete, 6 jul. 2022.

    Publikation: KonferencebidragKonferenceabstrakt til konferenceFormidling

  14. Udgivet

    Analysis of Neutralization Titers against SARS-CoV-2 in Health-Care Workers Vaccinated with Prime-Boost mRNA–mRNA or Vector–mRNA COVID-19 Vaccines

    Sølund, C., Underwood, Alexander Paul James, Fernandez-Antunez, C., Bollerup, S., Mikkelsen, L. S., Villadsen, S. L., Fahnøe, Ulrik, Winckelmann, Anni Assing, Feng, S., Nørløv Vinten, C. A., Dalegaard, M. I., Vizgirda, G., Sørensen, A. L., Ramirez Almeida, Santseharay, Bukh, Jens & Weis, Nina, 2022, I: Vaccines. 10, 1, 75.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  15. Udgivet

    HCV genome-wide analysis for development of efficient culture systems and unravelling of antiviral resistance in genotype 4

    Pham, Long, Pedersen, M. S., Fahnøe, Ulrik, Fernandez-Antunez, C., Humes, D., Schønning, Kristian, Ramirez Almeida, Santseharay & Bukh, Jens, 2022, I: Gut. 71, s. 627-642 20323585.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  16. Udgivet

    Nirmatrelvir-resistant SARS-CoV-2 variants with high fitness in an infectious cell culture system

    Zhou, Y., Gammeltoft, Karen Anbro, Ryberg, Line Abildgaard, Pham, Long, Tjørnelund, H. D., Binderup, A., Duarte Hernandez, Carlos Rene, Fernandez-Antunez, C., Offersgaard, Anna Falden, Fahnøe, Ulrik, Peters, G. H. J., Ramirez Almeida, Santseharay, Bukh, Jens & Gottwein, Judith Margarete, 2022, I: Science Advances. 8, 51, eadd7197.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  17. Udgivet

    Protection against SARS-CoV-2 transmission by a parenteral prime—Intranasal boost vaccine strategy

    Christensen, D., Polacek, C., Sheward, D. J., Hanke, L., Moliner-morro, A., Mcinerney, G., Murrell, B., Hartmann, Katrine Top, Jensen, Henrik Elvang, Jungersen, G., Illigen, K., Isling, L. K., Jensen, R. F., Hansen, J. S., Rosenkrands, I., Fernandez-antunez, C., Ramirez Almeida, Santseharay, Follmann, F., Bukh, Jens & Pedersen, G. K., 2022, I: EBioMedicine. 84, 104248.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  18. Udgivet

    Versatile SARS-CoV-2 Reverse-Genetics Systems for the Study of Antiviral Resistance and Replication

    Fahnøe, Ulrik, Pham, Long, Fernandez-Antunez, C., Costa, Rui, Rivera, Lizandro, Galli, Andrea, Feng, S., Mikkelsen, L. S., Gottwein, Judith Margarete, Scheel, Troels Kasper Høyer, Ramirez Almeida, Santseharay & Bukh, Jens, 2022, I: Viruses. 14, 2, 172.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  19. 2021
  20. Udgivet
  21. Udgivet

    Hepatitis C Virus Protease Inhibitors Show Differential Efficacy and Interactions with Remdesivir for Treatment of SARS-CoV-2 in Vitro

    Gammeltoft, Karen Anbro, Zhou, Y., Duarte Hernandez, C. R., Galli, Andrea, Offersgaard, Anna Falden, Costa, Rui, Pham, Long, Fahnøe, Ulrik, Feng, S., Scheel, Troels Kasper Høyer, Ramirez Almeida, Santseharay, Bukh, Jens & Gottwein, Judith Margarete, 2021, I: Antimicrobial Agents and Chemotherapy. 65, 9, e02680-20.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  22. Udgivet

    In vitro efficacy of artemisinin-based treatments against SARS-CoV-2

    Zhou, Y., Gilmore, K., Ramirez Almeida, Santseharay, Settels, E., Gammeltoft, Karen Anbro, Pham, Long, Fahnøe, Ulrik, Feng, S., Offersgaard, Anna Falden, Trimpert, J., Bukh, Jens, Osterrieder, K., Gottwein, Judith Margarete & Seeberger, P. H., 2021, I: Scientific Reports. 11, 14571.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  23. Udgivet
  24. Udgivet

    Neutralisation titres against SARS-CoV-2 are sustained 6 months after onset of symptoms in individuals with mild COVID-19

    Underwood, Alexander Paul James, Sølund, C., Fernandez-Antunez, C., Villadsen, S. L., Winckelmann, A. A., Bollerup, S., Mikkelsen, L. S., Sørensen, A. L., Feng, S., Fahnøe, Ulrik, Lassauniere, R., Fomsgaard, A., Ramirez Almeida, Santseharay, Weis, Nina & Bukh, Jens, 2021, I: EBioMedicine. 71, 103519.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  25. Udgivet

    Overcoming culture restriction for SARS-CoV-2 in human cells facilitates the screening of compounds inhibiting viral replication

    Ramirez Almeida, Santseharay, Fernandez-Antunez, C., Galli, Andrea, Underwood, Alexander Paul James, Pham, Long, Ryberg, Line Abildgaard, Feng, S., Pedersen, M. S., Mikkelsen, L. S., Belouzard, S., Dubuisson, J., Sølund, C., Weis, Nina, Gottwein, Judith Margarete, Fahnøe, Ulrik & Bukh, Jens, 2021, I: Antimicrobial Agents and Chemotherapy. 65, 7, 20 s., e00097-21.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  26. Udgivet

    Sars-cov-2 production in a scalable high cell density bioreactor

    Offersgaard, Anna Falden, Hernandez, C. R. D., Pihl, A. F., Costa, Rui, Venkatesan, N. P., Lin, X., Pham, Long, Feng, S., Fahnøe, Ulrik, Scheel, Troels Kasper Høyer, Ramirez Almeida, Santseharay, Reichl, U., Bukh, Jens, Genzel, Y. & Gottwein, Judith Margarete, 2021, I: Vaccines. 9, 7, 706.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  27. Udgivet

    Viral genome wide association study identifies novel hepatitis C virus polymorphisms associated with sofosbuvir treatment failure

    STOP-HCV Consortium, S. C., 2021, I: Nature Communications. 12, 1, 11 s., 6105.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  28. 2020
  29. Udgivet

    Cell culture studies of the efficacy and barrier to resistance of sofosbuvir-velpatasvir and glecaprevir-pibrentasvir against hepatitis C virus genotypes 2a, 2b, and 2C

    Ramirez Almeida, Santseharay, Fernandez-Antunez, C., Mikkelsen, L. S., Pedersen, J., Li, Y. P. & Bukh, Jens, 2020, I: Antimicrobial Agents and Chemotherapy. 64, 3, e01888.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  30. Udgivet
  31. Udgivet

    Insights into the unique characteristics of hepatitis C virus genotype 3 revealed by development of a robust sub-genomic DBN3a replicon

    Ward, J. C., Bowyer, S., Chen, S., Fernandes Campos, G. R., Ramirez Almeida, Santseharay, Bukh, Jens & Harris, M., 2020, I: The Journal of general virology. 101, 11, s. 1182-1190 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  32. Udgivet

    Mutations Identified in the Hepatitis C Virus (HCV) Polymerase of Patients with Chronic HCV Treated with Ribavirin Cause Resistance and Affect Viral Replication Fidelity

    Mejer, N., Fahnøe, Ulrik, Galli, Andrea, Ramirez Almeida, Santseharay, Weiland, O., Benfield, Thomas & Bukh, Jens, 2020, I: Antimicrobial Agents and Chemotherapy. 64, 12

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  33. Udgivet

    Ribavirin inhibition of cell-culture infectious hepatitis C genotype 1-3 viruses is strain-dependent

    Mejer, N., Galli, Andrea, Ramirez Almeida, Santseharay, Fahnøe, Ulrik, Benfield, Thomas & Bukh, Jens, 2020, I: Virology. 540, s. 132-140 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  34. 2019
  35. Udgivet

    Evolutionary Pathways to Persistence of Highly Fit and Resistant Hepatitis C Virus Protease Inhibitor Escape Variants

    Jensen, S. B., Fahnøe, U., Pham, L. V., Serre, S. B. N., Tang, Q., Ghanem, L., Pedersen, M. S., Ramirez, S., Humes, D., Pihl, A. F., Filskov, J., Sølund, C. S., Dietz, J., Fourati, S., Pawlotsky, J. M., Sarrazin, C., Weis, N., Schønning, K., Krarup, H., Bukh, J. & 1 flere, Gottwein, Judith Margarete, 2019, I: Hepatology. 70, 3, s. 771-787 17 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  36. Udgivet

    HCV genotype 1-6 NS3 residue 80 substitutions impact protease inhibitor activity and promote viral escape

    Pham, Long, Jensen, S. B., Fahnøe, Ulrik, Pedersen, M. S., Tang, Q., Ghanem, L., Ramirez Almeida, Santseharay, Humes, D., Serre, S. B. N., Schønning, Kristian, Bukh, Jens & Gottwein, Judith Margarete, 2019, I: Journal of Hepatology. 70, 3, s. 388-397

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  37. 2018
  38. Udgivet

    Efficacy of NS5A Inhibitors Against Hepatitis C Virus Genotypes 1–7 and Escape Variants

    Gottwein, Judith Margarete, Pham, Long, Mikkelsen, L. S., Ghanem, L., Ramirez Almeida, Santseharay, Scheel, Troels Kasper Høyer, Carlsen, T. H. R. & Bukh, Jens, apr. 2018, I: Gastroenterology. 154, 5, s. 1435-1448 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  39. Udgivet
  40. Udgivet

    HCV Genotype 6a Escape from and Resistance to Velpatasvir, Pibrentasvir, and Sofosbuvir in Robust Infectious Cell Culture Models

    Pham, Long, Ramirez Almeida, Santseharay, Gottwein, Judith Margarete, Fahnøe, Ulrik, Li, Y., Pedersen, J. & Bukh, Jens, 2018, I: Gastroenterology. 154, 8, s. 2194-2208.e12

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  41. Udgivet

    Recombinant hepatitis C virus genotype 5a infectious cell culture systems expressing minimal JFH1 NS5B sequences permit polymerase inhibitor studies

    Humes, D., Ramirez Almeida, Santseharay, Jensen, T. B., Li, Y. P., Gottwein, Judith Margarete & Bukh, Jens, 2018, I: Virology. 522, s. 177-192 16 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  42. Udgivet

    Ribavirin-induced mutagenesis across the complete open reading frame of hepatitis C virus genotypes 1a and 3a

    Mejer, N., Fahnøe, Ulrik, Galli, Andrea, Ramirez Almeida, Santseharay, Benfield, Thomas & Bukh, Jens, 2018, I: Journal of General Virology. 99, 8, s. 1066-1077 12 s., 001095.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  43. 2017
  44. Udgivet

    Efficient hepatitis c virus genotype 1b core-NS5A recombinants permit efficacy testing of protease and NS5A inhibitors

    Pham, Long, Ramirez Almeida, Santseharay, Carlsen, T. H. R., Li, Y., Gottwein, Judith Margarete & Bukh, Jens, 2017, I: Antimicrobial Agents and Chemotherapy. 61, 6, 19 s., e00037-17.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  45. 2016
  46. Udgivet

    Robust HCV Genotype 3a Infectious Cell Culture System Permits Identification of Escape Variants With Resistance to Sofosbuvir

    Ramirez Almeida, Santseharay, Mikkelsen, L. S., Gottwein, Judith Margarete & Bukh, Jens, nov. 2016, I: Gastroenterology. 151, 5, s. 973-985.e2

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  47. 2015
  48. Udgivet

    Substitutions at NS3 Residue 155, 156, or 168 of Hepatitis C Virus Genotypes 2 to 6 Induce Complex Patterns of Protease Inhibitor Resistance

    Jensen, S. B., Serre, S. B. N., Humes, D. G., Ramirez Almeida, Santseharay, Li, Y., Bukh, Jens & Gottwein, Judith Margarete, dec. 2015, I: Antimicrobial Agents and Chemotherapy. 59, 12, s. 7426-7436 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  49. Udgivet

    Efficient infectious cell culture systems of the hepatitis C virus (HCV) prototype strains HCV-1 and H77

    Li, Y., Ramirez Almeida, Santseharay, Mikkelsen, L. & Bukh, Jens, jan. 2015, I: Journal of Virology. 89, 1, s. 811-23 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  50. 2014
  51. Udgivet

    Nationwide experience of treatment with protease inhibitors in chronic hepatitis C patients in denmark: identification of viral resistance mutations

    Sølund, C., Krarup, H., Ramirez Almeida, Santseharay, Thielsen, P., Røge, B. T., Lunding, S., Barfod, Toke Seierøe, Madsen, Lone Galmstrup, Tarp, B., Christensen, P. B., Gerstoft, Jan, Laursen, A. L., Bukh, Jens, Weis, Nina & DANHEP Group, D. G., 2014, I: PLOS ONE. 9, 12, s. 1-20 20 s., e113034.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  52. 2013
  53. Udgivet

    Characterization of hepatitis C virus recombinants with chimeric E1/E2 envelope proteins and identification of single amino acids in the E2 stem region important for entry

    Carlsen, T. H. R., Scheel, Troels Kasper Høyer, Ramirez Almeida, Santseharay, Foung, S. K. H. & Bukh, Jens, 2013, I: Journal of Virology. 87, 3, s. 1385-99 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

ID: 124402420